Wild Tricoders: Malimplikado de la Wildlife Mysteries de Everest kun eDNA

Sciencistoj trovas pruvojn de 187 taksonomiaj ordoj en 20 litroj da akvo kolektita de unu el la plej severaj medioj sur la Tero.
Teamo de sciencistoj gviditaj de la Wildlife Conservation Society (WCS) kaj Appalachian State University uzis median DNA (eDNA) por dokumenti la alpan biodiversecon de la plej alta monto sur la tero, la 29,032-futa (8,849 metroj) larĝa Monto Everest. Ĉi tiu grava laboro estas parto de la pionira 2019 National Geographic kaj Rolex Perpetual Planet Everest Expedition, la plej granda iam scienca Everest-ekspedicio.
Skribante pri siaj trovoj en la ĵurnalo iScience, la teamo kolektis eDNA de akvoprovaĵoj de dek lagetoj kaj riveretoj ĉe profundoj intervalantaj de 14,763 futoj (4,500 metroj) ĝis 18,044 futoj (5,500 metroj) dum kvar semajnoj. Tiuj ejoj inkludas areojn de alpaj zonoj kiuj ekzistas super la arbolimo kaj enhavas vicon da florplanto kaj arbedospecioj, same kiel eoliajn zonojn kiuj etendiĝas preter florplantoj kaj arbedoj kontraŭflue en la biosfero. Ili identigis organismojn apartenantaj al 187 taksonomiaj ordoj el nur 20 litroj da akvo, ekvivalenta al 16.3%, aŭ unu sesono, de la tutsumo de konataj ordoj en la Arbo de Vivo, la genealogia arbo de la biodiverseco de la Tero.
eDNA serĉas spurkvantojn de genetika materialo postlasitaj de organismoj kaj faŭno kaj disponigas pli pageblan, pli rapidan kaj pli ampleksan metodon por plibonigi esplorkapablojn por taksado de biodiverseco en la akva medio. Provaĵoj estas kolektitaj uzante sigelitan skatolon enhavantan filtrilon kiu kaptas genetikan materialon, kiu tiam estas analizita en laboratorio uzante DNA-metabarkodigon kaj aliajn sekvencteknikojn. WCS uzas eDNA por malkovri rarajn kaj endanĝerigitajn speciojn de ĝibaj balenoj ĝis Swinhoe-molaj testudoj, unu el la plej raraj specioj sur la Tero.
Varmapo de sekvenco legas de bakterioj identigitaj kaj klasifikitaj en taksonomia sinsekvo uzante SingleM kaj la Greengenes-datumbazon de ĉiu ejo.
Kvankam la esplorado de Everest temigis ord-nivelan identigon, la teamo povis identigi multajn organismojn malsupren al la genro aŭ specionivelo.
Ekzemple, la teamo identigis rotiferojn kaj tardigradejn, du etajn bestojn konatajn prosperi en iuj el la plej severaj kaj plej ekstremaj medioj kaj estas konsideritaj iuj el la plej rezistemaj bestoj konataj sur la Tero. Krome, ili malkovris la tibetan neĝan idon trovitan en la Nacia Parko Sagarmatha kaj estis surprizitaj trovi speciojn kiel ekzemple hejmaj hundoj kaj kokidoj kiuj reprezentas la efikon de homaj agadoj sur la pejzaĝo.
Ili ankaŭ trovis pinojn kiuj povas esti trovitaj nur sur montoflankoj tre malproksime de kie ili specimenis, montrante kiel ventoblovita poleno vojaĝas alte en tiujn akvodislimojn. Alia estaĵo, kiun ili trovis en pluraj lokoj, estis la efemuŝo, konata indikilo de media ŝanĝo.
La eDNA-inventaro helpos estontan biomonitoradon de la alta Himalajo kaj retrospektivajn molekulajn studojn por taksi ŝanĝojn laŭlonge de la tempo ĉar klimat-induktita varmiĝo, glaĉera fandado kaj homaj efikoj ŝanĝas ĉi tiun rapide ŝanĝantan, mondfaman ekosistemon.
D-ro Tracey Seimon de la Programo pri Besto-Sano de WCS, kungvidanto de la teamo de Everest Biofield kaj ĉefesploristo, diris: "Estas multe da biodiverseco. La alpa medio, inkluzive de Monto Everest, devus esti konsiderata kiel kondiĉigita de kontinua longperspektiva monitorado de alpa biodiverseco, aldone al bioklimata monitorado kaj klimata ŝanĝo-efiktakso. ”
D-ro Marisa Lim de la Wildlife Conservation Society diris: "Ni iris al la tegmento de la mondo serĉante vivon. Jen kion ni trovis. Tamen, la rakonto ne finiĝas tie. helpi informi estontan inteligentecon."
Kundirektoro de Kampa esploro, National Geographic-esploristo kaj Asociita Profesoro ĉe Appalachian State University D-ro Anton Simon diris: “Antaŭ jarcento, kiam oni demandis: 'Kial iri al Everest?', brita grimpulo George Mallory respondis, 'Ĉar ĝi estis tie. Nia teamo de 2019 havis tre malsaman opinion: ni iris al Monto Everest ĉar ĝi estis informa kaj povis instrui nin pri la mondo en kiu ni vivas."
Disponigante ĉi tiun malfermfontan datumaron al la esplorkomunumo, la aŭtoroj esperas kontribui al la daŭra klopodo konstrui molekulajn rimedojn por studi kaj spuri ŝanĝojn en biodiverseco en la plej altaj montoj de la Tero.
Artikolcitaĵo: Lim et al., Uzante median DNA por taksi la biodiversecon de la Arbo de Vivo sur la suda flanko de Ĉomolungmo, iScience (2022) Marisa KV Lim, 1Anton Seimon, 2Batya Nightingale, 1Charles SI Xu, 3Stefan RP Holloy, 4Adam J. Solon, 5Nicholas B. Dragon, 5Steven K. Schmidt, 5Alex Tate, 6Sandra Alvin, 6Aurora K. Elmore,6,7 kaj Tracey A. Simon1,8,
1 Wildlife Conservation Society, Zoological Health Program, Bronx Zoo, Bronx, NY 10460, Usono 2 Appalachian State University, Sekcio de Geografio kaj Planado, Boone, NC 28608, Usono 3 McGill University, Redpath Sekcio de Muzeoj kaj Biologio, Montrealo, H3A 0G4 , CanadaQ94 Sekcio de Primaraj Industrioj, Wellington 6011, Nov-Zelando 5 Universitato de Kolorado, Sekcio de Ekologio kaj Evolua Biologio, Boulder, CO 80309, Usono 6 Nacia Geografia Societo, Vaŝingtono, 20036, USAQ107 Nacia Oceana kaj Atmosfera Administracio, Silver- Spring, MD 20910, Usono 8 Lead Contact* Communications
Misio: WCS savas faŭnon kaj faŭnon tra la mondo per scienco, konservado-klopodoj, edukado kaj inspirado de homoj aprezi naturon. Por plenumi nian mision, WCS estas bazita en la Bronx Zoo, uzante la plenan potencon de sia tutmonda konservada programo, kiu estas vizitata ĉiujare de 4 milionoj da homoj en preskaŭ 60 landoj kaj ĉiuj oceanoj de la mondo, same kiel kvin naturaj parkoj en Nova. Jorko. WCS kunigas sian kompetentecon en zooj kaj akvarioj por realigi sian konservadmision. Vizitu: newsroom.wcs.org Sekvu: @WCSNewsroom. Por pliaj informoj: 347-840-1242. Aŭskultu la podkaston de WCS Wild Audio ĉi tie.
Kiel la ĉefa publika institucio en la Sudoriento, Appalachian State University preparas studentojn vivi plenplenajn vivojn kiel tutmondaj civitanoj, kiuj komprenas kaj respondecas pri kreado de daŭrigebla estonteco por ĉiuj. La apalaĉa sperto kreskigas spiriton de inkludo kunigante homojn laŭ inspiraj manieroj akiri kaj krei scion, kreski holisme, agi kun pasio kaj persistemo, kaj ampleksi diversecon kaj diferencon. La Apalaĉoj, situantaj en la Blua Kresta Montoj, estas unu el 17 kampusoj en la Universitato de Norda Karolina sistemo. Kun preskaŭ 21,000 studentoj, Appalachian University havas malaltan studento-fakultato-proporcion kaj ofertas pli ol 150 bakalaŭrajn kaj bakalaŭrajn programojn.
La partnereco de National Geographic kun Rolex subtenas ekspediciojn por esplori la plej kritikajn lokojn sur la tero. Uzante mondfaman sciencan kompetentecon kaj avangardan teknologion por malkovri novajn komprenojn pri sistemoj kritikaj por la vivo sur la Tero, ĉi tiuj ekspedicioj helpas sciencistojn, decidantojn kaj lokajn komunumojn plani kaj trovi solvojn al klimataj kaj klimataj efikoj. La medio ŝanĝiĝas, rakontante la mirindaĵojn de nia mondo per potencaj rakontoj.
Dum preskaŭ jarcento, Rolex subtenis pionirajn esploristojn, kiuj serĉas antaŭenpuŝi la limojn de homa ebleco. La firmao moviĝis de rekomendado de esplorado por malkovro al protektado de la planedo farante longperspektivan engaĝiĝon subteni individuojn kaj organizojn uzante sciencon por kompreni kaj evoluigi solvojn al la hodiaŭaj mediaj problemoj.
Ĉi tiu engaĝiĝo estis plifortigita kun la lanĉo de Forever Planet en 2019, kiu komence temigis homojn, kiuj kontribuas al pli bona mondo per la Rolex-Premioj por Entrepreno, protektas la oceanojn per partnereco kun Mission Blue kaj faras klimatan ŝanĝon realaĵo. komprenite kiel parto de ĝia rilato kun la National Geographic Society.
La vastigita biletujo de aliaj partnerecoj adoptitaj sub la Eterna Planedo-iniciato nun inkludas: polusaj ekspedicioj kiuj puŝas la limojn de subakva esplorado; One Ocean Foundation kaj Menkab protektanta cetacean biodiversecon en Mediteranea Maro; Xunaan-Ha Ekspedicio rivelanta akvokvaliton en Jukatano, Meksiko; GRANDA ekspedicio al la Arkto en 2023 por kolekti datumojn pri arktaj minacoj; Hearts In The Ice, ankaŭ por kolekti informojn pri klimata ŝanĝo en la Arkto; kaj la Monako-Blua Iniciato, kunigante ekspertojn pri maraj konservadsolvoj.
Rolex ankaŭ subtenas organizojn kaj iniciatojn kiuj nutras la venontan generacion de esploristoj, sciencistoj kaj ekologiistoj per stipendioj kaj subvencioj kiel la Monda Subakva Stipendio-Asocio kaj la Rolex Explorers Club Grant.
La Nacia Geografia Societo estas tutmonda neprofita organizaĵo, kiu uzas la potencon de scienco, esplorado, edukado kaj rakontado por lumigi kaj protekti la mirindaĵojn de nia mondo. Ekde 1888, National Geographic puŝas la limojn de esplorado, investas en aŭdaca talento kaj transformaj ideoj, disponigante pli ol 15,000 dungadsubvenciojn sur sep kontinentoj, atingante 3 milionojn da studentoj ĉiujare kun edukaj proponoj, kaj kaptante tutmondan atenton per subskriboj. , rakontoj kaj enhavo. Por lerni pli, vizitu www.nationalgeographic.org aŭ sekvu nin ĉe Instagram, Twitter kaj Facebook.
Misio: WCS savas faŭnon kaj faŭnon tra la mondo per scienco, konservado-klopodoj, edukado kaj inspirado de homoj aprezi naturon. Bazita en la Zoo de Bronx, WCS uzas la plenan potencon de sia tutmonda konservadprogramo por plenumi sian mision, kun 4 milionoj da vizitantoj ĉiujare en preskaŭ 60 landoj kaj ĉiuj oceanoj de la mondo, same kiel kvin naturaj parkoj en Novjorko. WCS kunigas sian kompetentecon en zooj kaj akvarioj por realigi sian konservadmision. Vizitu newsroom.wcs.org. Abonu: @WCSNewsroom. Pliaj informoj: +1 (347) 840-1242.
Kunfondinto de SpaceRef, membro de la Esploristoj-Klubo, eks-NASA, vizitanta teamo, ĵurnalisto, spaco kaj astrobiologo, malsukcesa grimpulo.


Afiŝtempo: Sep-10-2022